Breve reseña histórica de la Sección Educación:
Con la Constitución de 1870 el Archivo Nacional de Asunción pasó a formar parte del Ministerio del Interior, que a su vez dependía del Poder Ejecutivo.
Durante el Gobierno de Emilio Aceval se dictó la ley del 25 de abril de 1901 por la cual se fundó la Dirección General de Biblioteca, Museo y Archivo Nacional. Desde entonces, el Archivo Nacional pasa a depender del Ministerio de Justicia, Culto es Instrucción Pública, así fue como el Archivo Nacional, con los años fue resguardando más de 946 volúmenes, correspondientes al archivo antiguo del Ministerio de Justicia, Culto e Instrucción pública, la misma contiene archivos administrativos, informes de cárceles públicas, denuncias, leyes, entre otros temas concernientes al Ministerio del Interior.
En otro subfondo tenemos al Consejo Nacional de Educación, la misma contiene; notas, creación de escuelas, planilla de alumnos, honorarios de docentes, solicitudes de refracción, renuncias y nombramientos, entre muchos otros temas, concernientes a la Educación paraguaya, los mismos datan de finales del siglo XIX hasta mediados del siglo XX. Lo que le hace interesante a esta sección es la fusión de documentos que encontramos entre el Ministerio de Justicia y la Instrucción Pública.